ГИИМ финансирует и поддерживает проекты, а также проводит самостоятельные исследования в области российской/советской и немецкой истории, а также германо-российских/советских отношений в их международном контексте. Особый исследовательский интерес для Института представляют вопросы историографии, а также процессы трансфера культур и культурного обмена.

В настоящее время идет работа над следующими проектами

• Ubi universitas, ibi Europa
• Культура и быт дворянства в русской провинции XVIII века
• Концепты исследований раннего Нового времени
• История понятий
• История Большого террора
• Первая и Вторая мировые войны
• Публикация писем Пауля Вестхайма
• Проект издания рабочих дневников генерального секретаря ЦК КПСС Л.И. Брежнева

Годовые стипендии на 2010/2011 г. по следующим проектам

• Образ жизни и быт дворянства Российской империи (1762–1850 гг.)
• Советские чекисты в Германии. 1945–1954 гг.
• Брянская область в период немецкой оккупации, 1941–1943 гг.
• Мусульмане на службе в царской и советской армии. Множественность лояльностей и представлений о государственном устройстве (1870-1920-е гг.)